Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms