Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYBA4P53673 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms