Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HK3P52790 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HK3P52790 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HK3P52790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HK3P52790 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HK3P52790 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HK3P52790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HK3P52790 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HK3P52790 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HK3P52790 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HK3P52790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HK3P52790 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HK3P52790 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms