Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF2A2P52657 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms