Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms