Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGS4P49798 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGS4P49798 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGS4P49798 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGS4P49798 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGS4P49798 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RGS4P49798 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGS4P49798 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGS4P49798 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGS4P49798 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGS4P49798 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGS4P49798 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms