Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK2P49760 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK2P49760 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK2P49760 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK2P49760 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK2P49760 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK2P49760 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK2P49760 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLK2P49760 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK2P49760 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK2P49760 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK2P49760 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK2P49760 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK2P49760 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK2P49760 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK2P49760 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms