Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIM1P49642 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms