Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 AGO3-207ENST00000634486 3599 ntTSL 515.55■□□□□ 0.087e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 GALNT2-205ENST00000494106 692 ntTSL 514.88□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.687e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.037e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 ADAR-208ENST00000529168 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.47□□□□□ -1.217e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.547e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 CAMTA1-202ENST00000461311 431 ntTSL 24.8□□□□□ -1.647e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 520.67■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 34.3
AARSP49588 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 518.43■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 34.3
AARSP49588 EIF4G1-208ENST00000413967 2808 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 34.3
AARSP49588 EIF4G1-213ENST00000426123 2907 ntTSL 217.85■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 34.3
AARSP49588 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 318.44■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 34.2
AARSP49588 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.825e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.595e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 220.9■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)17.56■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 513.24□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 HNRNPUL1-211ENST00000597725 573 ntTSL 410.71□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 34.1
AARSP49588 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 215.21■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 33.5
AARSP49588 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 27.15□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 33.2
AARSP49588 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 33.1
AARSP49588 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 33.1
AARSP49588 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 33.1
AARSP49588 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.855e-6■■■■■ 33.1
AARSP49588 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.237e-6■■■■■ 33.1
AARSP49588 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.097e-6■■■■■ 33.1
AARSP49588 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 13e-8■■■■■ 32.8
AARSP49588 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 32.8
AARSP49588 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 32.8
AARSP49588 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 32.8
AARSP49588 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 32.8
AARSP49588 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 26.08□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 32.8
AARSP49588 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 320.95■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 32.7
AARSP49588 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 220.18■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 32.7
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AARSP49588 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 32.7
AARSP49588 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.166e-6■■■■■ 32.7
AARSP49588 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 315.95■□□□□ 0.146e-6■■■■■ 32.7
AARSP49588 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.466e-6■■■■■ 32.7
AARSP49588 GATD1-202ENST00000354286 3973 ntTSL 511.57□□□□□ -0.566e-6■■■■■ 32.7
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AARSP49588 GRIPAP1-202ENST00000473581 3278 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 32.6
AARSP49588 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 32.6
AARSP49588 GRIPAP1-209ENST00000611757 3255 ntTSL 210.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 32.6
AARSP49588 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 519.02■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 31.8
AARSP49588 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 214.83□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 31.8
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AARSP49588 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 31.8
AARSP49588 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 31.8
AARSP49588 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 412.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 31.7
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AARSP49588 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 422.71■■□□□ 1.236e-7■■■■■ 31.5
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AARSP49588 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-215ENST00000541683 1844 ntTSL 218.37■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 317.92■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-207ENST00000466716 640 ntTSL 516.54■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-209ENST00000491310 525 ntTSL 515.02■□□□□ -06e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 314.43□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 313.73□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 FADS1-205ENST00000448607 559 ntTSL 413.08□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 31.5
AARSP49588 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.342e-6■■■■■ 31.5
AARSP49588 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 31.5
AARSP49588 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 31.5
AARSP49588 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 53.97□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 31.5
AARSP49588 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 31.1
AARSP49588 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 511.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 31.1
AARSP49588 DDX39A-205ENST00000586993 585 ntTSL 424.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-215ENST00000590696 563 ntTSL 423.66■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 522.48■■□□□ 1.196e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 322.04■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-207ENST00000588542 1297 ntTSL 321.86■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-204ENST00000586558 1127 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 319.86■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-212ENST00000590260 988 ntTSL 219.8■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-216ENST00000591275 484 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 NAA10-214ENST00000482485 1075 ntTSL 216.86■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 416.68■□□□□ 0.266e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-209ENST00000589318 1903 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-17■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-211ENST00000590239 565 ntTSL 416.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 414.86□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 30.9
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