Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU3F4P49335 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms