Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms