Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMTP48728 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMTP48728 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMTP48728 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMTP48728 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMTP48728 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMTP48728 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMTP48728 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMTP48728 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMTP48728 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMTP48728 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMTP48728 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms