Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRIP1P48552 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms