Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UTRNP46939 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UTRNP46939 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UTRNP46939 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UTRNP46939 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UTRNP46939 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
UTRNP46939 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTRNP46939 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UTRNP46939 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTRNP46939 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTRNP46939 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTRNP46939 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UTRNP46939 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UTRNP46939 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UTRNP46939 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UTRNP46939 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UTRNP46939 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UTRNP46939 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UTRNP46939 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UTRNP46939 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms