Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL21P46778 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL21P46778 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL21P46778 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL21P46778 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL21P46778 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL21P46778 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPL21P46778 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPL21P46778 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL21P46778 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL21P46778 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL21P46778 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL21P46778 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL21P46778 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPL21P46778 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL21P46778 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms