Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms