Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFMP43652 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFMP43652 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFMP43652 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFMP43652 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFMP43652 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFMP43652 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFMP43652 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFMP43652 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFMP43652 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFMP43652 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFMP43652 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFMP43652 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFMP43652 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFMP43652 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFMP43652 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFMP43652 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFMP43652 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFMP43652 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFMP43652 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AFMP43652 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFMP43652 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms