Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR1P43307 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR1P43307 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR1P43307 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR1P43307 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR1P43307 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR1P43307 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR1P43307 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR1P43307 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR1P43307 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR1P43307 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR1P43307 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR1P43307 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSR1P43307 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR1P43307 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms