Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCAMP43121 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCAMP43121 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCAMP43121 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCAMP43121 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCAMP43121 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCAMP43121 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCAMP43121 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCAMP43121 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCAMP43121 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCAMP43121 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCAMP43121 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCAMP43121 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCAMP43121 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCAMP43121 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCAMP43121 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCAMP43121 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCAMP43121 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCAMP43121 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms