Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC1A4P43007 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms