Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms