Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPOP42166 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMPOP42166 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMPOP42166 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPOP42166 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPOP42166 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMPOP42166 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMPOP42166 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMPOP42166 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMPOP42166 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMPOP42166 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMPOP42166 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMPOP42166 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMPOP42166 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMPOP42166 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMPOP42166 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMPOP42166 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMPOP42166 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMPOP42166 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPOP42166 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPOP42166 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPOP42166 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPOP42166 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPOP42166 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPOP42166 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPOP42166 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPOP42166 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms