Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms