Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX2P40425 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX2P40425 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX2P40425 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX2P40425 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX2P40425 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX2P40425 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX2P40425 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX2P40425 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PBX2P40425 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms