Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAL1P37235 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAL1P37235 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms