Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT2P35908 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT2P35908 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT2P35908 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT2P35908 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT2P35908 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT2P35908 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT2P35908 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT2P35908 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT2P35908 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT2P35908 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT2P35908 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT2P35908 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT2P35908 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT2P35908 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT2P35908 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT2P35908 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms