Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1BP35680 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms