Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCK1P35558 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK1P35558 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK1P35558 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCK1P35558 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK1P35558 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK1P35558 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCK1P35558 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms