Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BMI1P35226 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMI1P35226 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms