Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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