Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND3P30281 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND3P30281 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND3P30281 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND3P30281 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND3P30281 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND3P30281 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND3P30281 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND3P30281 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND3P30281 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND3P30281 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND3P30281 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND3P30281 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND3P30281 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND3P30281 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCND3P30281 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCND3P30281 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCND3P30281 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCND3P30281 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND3P30281 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND3P30281 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND3P30281 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND3P30281 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND3P30281 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND3P30281 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND3P30281 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND3P30281 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND3P30281 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND3P30281 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND3P30281 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND3P30281 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND3P30281 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND3P30281 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND3P30281 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND3P30281 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms