Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNGA1P29973 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms