Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms