Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms