Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD34P28906 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD34P28906 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD34P28906 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD34P28906 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD34P28906 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD34P28906 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD34P28906 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD34P28906 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD34P28906 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD34P28906 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD34P28906 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms