Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTFRP26992 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms