Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms