Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2AP24928 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms