Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNCP24863 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNCP24863 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNCP24863 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNCP24863 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNCP24863 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNCP24863 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNCP24863 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNCP24863 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNCP24863 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNCP24863 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNCP24863 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNCP24863 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNCP24863 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms