Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPH2P23942 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPH2P23942 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms