Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPREP23469 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPREP23469 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPREP23469 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPREP23469 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPREP23469 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPREP23469 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPREP23469 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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