Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLDCP23378 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLDCP23378 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GLDCP23378 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLDCP23378 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLDCP23378 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms