Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME2P23368 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME2P23368 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME2P23368 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME2P23368 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME2P23368 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME2P23368 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME2P23368 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME2P23368 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ME2P23368 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME2P23368 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ME2P23368 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ME2P23368 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms