Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACO1P21399 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACO1P21399 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACO1P21399 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACO1P21399 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACO1P21399 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACO1P21399 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACO1P21399 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACO1P21399 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACO1P21399 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACO1P21399 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACO1P21399 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACO1P21399 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACO1P21399 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACO1P21399 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACO1P21399 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACO1P21399 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACO1P21399 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACO1P21399 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms