Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NF1P21359 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NF1P21359 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NF1P21359 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NF1P21359 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NF1P21359 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NF1P21359 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NF1P21359 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NF1P21359 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NF1P21359 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NF1P21359 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NF1P21359 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NF1P21359 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NF1P21359 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms