Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN3P20807 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN3P20807 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN3P20807 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN3P20807 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN3P20807 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms