Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTF3P20783 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTF3P20783 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTF3P20783 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NTF3P20783 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms