Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms