Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFE3P19532 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFE3P19532 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFE3P19532 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFE3P19532 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFE3P19532 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFE3P19532 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFE3P19532 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFE3P19532 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms