Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCLP19338 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCLP19338 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCLP19338 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCLP19338 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCLP19338 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCLP19338 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCLP19338 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCLP19338 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCLP19338 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCLP19338 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCLP19338 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCLP19338 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCLP19338 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCLP19338 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCLP19338 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms